We, researchers have pain while writing papers, especially placing figures, giving citations… Most of the Computer Science researchers use LaTeX for writing their papers. Since paper writing is not a short process, combining citations from various sources, in time, may lead to long citation lists which are not sorted. It takes too long to sort [...]

When you have lots of always changing python files in a directory or  these modules are imported by other modules, you encounter seeing lots of pyc and py~ files together with those files. This is irritating, at least for me. For that reason, I wish if I could remove these residue files with a right [...]

If you are doing protein research, you’ll eventually need to use protein databases. There lots of them. Querying these databases on the web might take some time and Firefox search engine plugins makes it easier. I found a web site where various search plugins can be found. I found one plugin for Uniprot database and [...]

Bu yazımda size bir C++ veri yapıları ve algoritma kütüphanesi olan LEDA‘nın Pardus Linux üzerinde kurulumunu anlatacağım. LEDA’nın ücretsiz sürümünü sitesinden indirebilirsiniz. Anlatımda kullanacağım kullanıcı adı “emre” yerine kendi kullanıcı adınızı yazmanız gerekmekte. Kaynak kodları istediğimiz bir yere açıyoruz. Ben /home/emre/lib/LEDA altına açtım. Bir metin düzenleyicisi ile (nano, vim, kwrite, vs.) /home/emre/.bashrc dosyasını açıyor (yoksa [...]

Üniversitede Bioinformatics dersini alırken oldukça eğlenceli oyunlar/problemler gördük. Bunlardan birisi de Towers of Hanoi – Hanoi Kuleleri idi. Dönemin başında bol vakit olduğu için de oturup bu problemi çözen C, Python ve Java kodu yazmıştım. Ardından da bu dillerde yazılan eş-işlevli programların performansını değerlendirmiştim. Kodları ve sonuçları sizinle paylaşmak istedim. HANOITOWERS fonksiyonlarına gönderilen parametreler ise [...]